O laboratório de Química Aplicada é um espaço físico equipado especialmente por diversos instrumentos, elementos ou equipamentos de medição adequados, dotado de personalidade jurídica tutelado pelo Centro Tecnológico Nacional a fim de atender as demandas e necessidades de diversas experiências para o apoio dos laboratórios do CTN no desenvolvimento da investigação e extensão de serviços para a comunidade.
O laboratório de Química Aplicada do Centro Tecnológico Nacional (CTN) tem como sua missão realizar trabalhos de investigação científica e apoio aos outros laboratórios.
As actividades de apoio à investigação científica, desenvolvimento tecnológico e inovação do Laboratório de Química Aplicada do CTN organizam-se actualmente em três Equipas de Investigação (Traçadores Radioactivos, Hidrologia Isotópica e Cultura de Tecidos) que se subdividem em três Linhas de Investigação: